Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MKLN1Q9UL63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKLN1Q9UL63 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKLN1Q9UL63 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKLN1Q9UL63 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKLN1Q9UL63 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms