Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV3

ACIN1, Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACIN1Q9UKV3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ACIN1Q9UKV3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ACIN1Q9UKV3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ACIN1Q9UKV3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ACIN1Q9UKV3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ACIN1Q9UKV3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
ACIN1Q9UKV3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ACIN1Q9UKV3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ACIN1Q9UKV3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ACIN1Q9UKV3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms