Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MRTO4Q9UKD2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms