Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBE1Q9UJT0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBE1Q9UJT0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms