Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLS1Q9UJA2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRLS1Q9UJA2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms