Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD1Q9UIS9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD1Q9UIS9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.8 ms