Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIQ6

LNPEP, Leucyl-cystinyl aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPEPQ9UIQ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNPEPQ9UIQ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNPEPQ9UIQ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LNPEPQ9UIQ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms