Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED13Q9UHV7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms