Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT1Q9UHJ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFMBT1Q9UHJ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.6 ms