Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPS1Q9UHF7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPS1Q9UHF7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms