Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3BQ9UH17 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC3BQ9UH17 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms