Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms