Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM8A1Q9UBU6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM8A1Q9UBU6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM8A1Q9UBU6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM8A1Q9UBU6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM8A1Q9UBU6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM8A1Q9UBU6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM8A1Q9UBU6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM8A1Q9UBU6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM8A1Q9UBU6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM8A1Q9UBU6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms