Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT2

UBA2, SUMO-activating enzyme subunit 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA2Q9UBT2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA2Q9UBT2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA2Q9UBT2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA2Q9UBT2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBA2Q9UBT2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBA2Q9UBT2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms