Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CPNE7Q9UBL6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPNE7Q9UBL6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPNE7Q9UBL6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms