Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL9Q9P2J3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL9Q9P2J3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms