Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED11Q9P086 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MED11Q9P086 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms