Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL39Q9NYK5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms