Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DLL3Q9NYJ7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DLL3Q9NYJ7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms