Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOXC10Q9NYD6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC10Q9NYD6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms