Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A4Q9NY91 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC5A4Q9NY91 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms