Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ING3Q9NXR8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms