Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMPD4Q9NXE4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD4Q9NXE4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms