Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM260Q9NX78 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM260Q9NX78 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM260Q9NX78 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM260Q9NX78 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms