Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLIMQ9NVW2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLIMQ9NVW2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms