Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCMTD2Q9NV79 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms