Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPTLC3Q9NUV7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC3Q9NUV7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms