Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP5S1Q9NUS5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP5S1Q9NUS5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms