Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKDREJQ9NTG1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDREJQ9NTG1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms