Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SALL1Q9NSC2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms