Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3GQ9NS98 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA3GQ9NS98 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms