Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNNM1Q9NRU3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNNM1Q9NRU3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNNM1Q9NRU3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNNM1Q9NRU3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNNM1Q9NRU3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNNM1Q9NRU3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNNM1Q9NRU3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms