Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TULP4Q9NRJ4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TULP4Q9NRJ4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TULP4Q9NRJ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms