Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SNRKQ9NRH2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNRKQ9NRH2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNRKQ9NRH2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNRKQ9NRH2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms