Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG1

PRTFDC1, Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTFDC1Q9NRG1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRTFDC1Q9NRG1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRTFDC1Q9NRG1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms