Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-215ENST00000534368 684 ntTSL 36.19□□□□□ -1.426e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 ITFG1-203ENST00000542691 1464 ntTSL 24.24□□□□□ -1.736e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 CAMTA1-213ENST00000490738 538 ntTSL 221.35■■□□□ 1.018e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.358e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.148e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 CAMTA1-209ENST00000476163 863 ntTSL 214.87□□□□□ -0.038e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.068e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 ZNF236-203ENST00000543926 8206 ntTSL 1 (best)10.07□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.248e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 CAMTA1-202ENST00000461311 431 ntTSL 23.84□□□□□ -1.798e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-211ENST00000443532 968 ntTSL 517.58■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-204ENST00000413463 542 ntTSL 516.15■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-212ENST00000446202 548 ntTSL 416.15■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-215ENST00000480357 5668 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-209ENST00000437134 760 ntTSL 512.77□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-203ENST00000412508 585 ntTSL 212.68□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-217ENST00000482031 1038 ntTSL 312□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 UBE2F-SCLY-202ENST00000449891 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.58□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-207ENST00000431487 568 ntTSL 511.57□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-206ENST00000423324 628 ntTSL 411.57□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SCLY-216ENST00000480859 506 ntTSL 510.93□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 SMYD3-210ENST00000470863 983 ntTSL 212.52□□□□□ -0.418e-7■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 36.8
EXOSC5Q9NQT4 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 36.8
EXOSC5Q9NQT4 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 36.8
EXOSC5Q9NQT4 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 36.8
EXOSC5Q9NQT4 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.253e-7■■■■■ 36.8
EXOSC5Q9NQT4 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.253e-7■■■■■ 36.8
EXOSC5Q9NQT4 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 36.8
EXOSC5Q9NQT4 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 36.8
EXOSC5Q9NQT4 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 36.8
EXOSC5Q9NQT4 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 36.8
EXOSC5Q9NQT4 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 36.8
EXOSC5Q9NQT4 TPTE2P2-206ENST00000606973 3746 ntTSL 55.99□□□□□ -1.451e-6■■■■■ 36.7
EXOSC5Q9NQT4 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC5.96□□□□□ -1.451e-6■■■■■ 36.7
EXOSC5Q9NQT4 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 36.7
EXOSC5Q9NQT4 TPTE2P2-204ENST00000606043 529 ntTSL 55.38□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 36.7
EXOSC5Q9NQT4 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 36.7
EXOSC5Q9NQT4 TERT-204ENST00000484238 2422 ntTSL 514.47□□□□□ -0.096e-8■■■■■ 36.7
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-213ENST00000468928 900 ntTSL 311.27□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 36.6
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 218.07■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 36.6
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 36.6
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.386e-7■■■■■ 36.6
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 36.6
EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.283e-7■■■■■ 36.5
EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.263e-7■■■■■ 36.5
EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 36.5
EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 36.5
EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF7-210ENST00000449979 682 ntTSL 513.23□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 36.5
EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 36.5
EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF7-212ENST00000467053 691 ntTSL 311.73□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 36.5
EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF7-211ENST00000466143 1681 ntTSL 511.71□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 36.5
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EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 36.5
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EXOSC5Q9NQT4 NDUFS4-201ENST00000296684 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.155e-8■■■■■ 36.5
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EXOSC5Q9NQT4 NDUFS4-205ENST00000507026 680 ntTSL 37.4□□□□□ -1.225e-8■■■■■ 36.5
EXOSC5Q9NQT4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.336e-8■■■■■ 36.4
EXOSC5Q9NQT4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.446e-8■■■■■ 36.4
EXOSC5Q9NQT4 DEK-204ENST00000505224 1372 ntTSL 211.91□□□□□ -0.56e-8■■■■■ 36.4
EXOSC5Q9NQT4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 MPP6-206ENST00000432190 982 ntTSL 318.37■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 MPP6-205ENST00000430180 1191 ntTSL 515□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 NCK1-209ENST00000485096 571 ntTSL 413.54□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 NCK1-211ENST00000491539 587 ntTSL 411.22□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 NCK1-210ENST00000488930 526 ntTSL 51.44□□□□□ -2.182e-8■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.449e-12■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.119e-12■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 315.11■□□□□ 0.019e-12■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 515.11■□□□□ 0.019e-12■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 514.28□□□□□ -0.129e-12■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 414.17□□□□□ -0.149e-12■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.169e-12■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 513.76□□□□□ -0.219e-12■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 58.81□□□□□ -19e-12■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 37.45□□□□□ -1.229e-12■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-219ENST00000526253 439 ntTSL 56.89□□□□□ -1.316e-7■■■■■ 36.3
EXOSC5Q9NQT4 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 36.2
EXOSC5Q9NQT4 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 514□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 55.02□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.921e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 VPS13B-208ENST00000521037 486 ntTSL 53.46□□□□□ -1.861e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-251ENST00000523797 405 ntTSL 317.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 416.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 36.1
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