Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIT2Q9NQR4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIT2Q9NQR4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms