Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.56■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms