Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD45

TM9SF3, Transmembrane 9 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF3Q9HD45 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM9SF3Q9HD45 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM9SF3Q9HD45 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF3Q9HD45 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms