Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PREBQ9HCU5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms