Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD248Q9HCU0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD248Q9HCU0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD248Q9HCU0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD248Q9HCU0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD248Q9HCU0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD248Q9HCU0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD248Q9HCU0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD248Q9HCU0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD248Q9HCU0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD248Q9HCU0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD248Q9HCU0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD248Q9HCU0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD248Q9HCU0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms