Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC24A3Q9HC58 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms