Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LY9Q9HBG7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LY9Q9HBG7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LY9Q9HBG7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LY9Q9HBG7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms