Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9A7

RMI1, RecQ-mediated genome instability protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI1Q9H9A7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMI1Q9H9A7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RMI1Q9H9A7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RMI1Q9H9A7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms