Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP4Q9H6H4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP4Q9H6H4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REEP4Q9H6H4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms