Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRN3Q9H3W5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRN3Q9H3W5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN3Q9H3W5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms