Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC68Q9H2F9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms