Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED28Q9H204 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED28Q9H204 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms