Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL25Q9H0H3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL25Q9H0H3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms