Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D6

XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRN2Q9H0D6 TCF25-203ENST00000561585 981 ntTSL 220.92■□□□□ 0.946e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TCF25-204ENST00000561958 763 ntTSL 320.71■□□□□ 0.916e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFXN5-221ENST00000495208 808 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 MUS81-211ENST00000530111 692 ntTSL 320.48■□□□□ 0.875e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SECTM1-205ENST00000581954 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 420.44■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.855e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.835e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 MZT2A-202ENST00000410036 382 ntTSL 519.94■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TCF25-214ENST00000565196 655 ntTSL 519.93■□□□□ 0.786e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFMBT1-203ENST00000474837 579 ntTSL 419.87■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-217ENST00000552109 1034 ntTSL 219.75■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-218ENST00000552928 545 ntTSL 319.75■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-215ENST00000592372 867 ntTSL 319.71■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AMN-203ENST00000558590 2772 ntTSL 219.55■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ATP2B1-209ENST00000551310 607 ntTSL 319.54■□□□□ 0.725e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)19.49■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.75e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-205ENST00000570322 1083 ntTSL 319.37■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CPLX2-205ENST00000509837 557 ntTSL 419.23■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFXN5-220ENST00000490056 906 ntTSL 1 (best)19.11■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EBF4-204ENST00000463145 642 ntTSL 519.05■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-215ENST00000529306 870 ntTSL 318.87■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-212ENST00000527485 873 ntTSL 218.87■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EGFR-208ENST00000459688 452 ntTSL 318.86■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-202ENST00000547219 611 ntTSL 518.72■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-207ENST00000550169 570 ntTSL 318.72■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 PRKCZ-224ENST00000503297 468 ntTSL 518.66■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-209ENST00000547351 807 ntTSL 218.47■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TNRC18-210ENST00000497663 588 ntTSL 218.4■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ASL-206ENST00000464970 640 ntTSL 318.21■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AC068580.4-202ENST00000636579 350 ntTSL 318.18■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ASL-208ENST00000488343 198 ntTSL 317.99■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-211ENST00000588767 807 ntTSL 517.93■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-217ENST00000593166 797 ntTSL 317.84■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EBF4-211ENST00000609967 2861 ntTSL 517.82■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 APOE-205ENST00000485628 771 ntTSL 1 (best)17.79■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AGPAT1-207ENST00000476663 746 ntTSL 517.64■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 MZT2A-205ENST00000488586 234 ntTSL 517.59■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFMBT1-205ENST00000483069 617 ntTSL 417.44■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-206ENST00000570500 473 ntTSL 217.4■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-209ENST00000573513 827 ntTSL 517.4■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 IDH3B-207ENST00000477689 608 ntTSL 517.39■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFMBT1-208ENST00000497586 699 ntTSL 417.15■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.255e-19■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TTLL3-212ENST00000430718 536 ntTSL 416.39■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TTLL3-203ENST00000414814 549 ntTSL 516.39■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CYB5R3-207ENST00000466276 581 ntTSL 416.19■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.175e-19■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SECTM1-207ENST00000582563 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.96■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SECTM1-208ENST00000583093 556 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.96■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AC096887.1-202ENST00000607283 690 ntAPPRIS P5 TSL 515.7■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ZNF331-208ENST00000504940 350 ntTSL 315.59■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TTLL3-205ENST00000418745 540 ntTSL 415.58■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 GTPBP2-205ENST00000442748 946 ntTSL 315.49■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-204ENST00000548154 597 ntTSL 215.49■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-203ENST00000547414 521 ntTSL 515.33■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-210ENST00000550937 781 ntTSL 515.33■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KNOP1-204ENST00000567367 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.07■□□□□ 05e-7■■■■■ 39.7
Retrieved 100 of 21,068 protein–RNA pairs in 381.8 ms