Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D6

XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRN2Q9H0D6 TCF25-203ENST00000561585 981 ntTSL 220.92■□□□□ 0.946e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TCF25-204ENST00000561958 763 ntTSL 320.71■□□□□ 0.916e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFXN5-221ENST00000495208 808 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 MUS81-211ENST00000530111 692 ntTSL 320.48■□□□□ 0.875e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SECTM1-205ENST00000581954 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 420.44■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.855e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.835e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 MZT2A-202ENST00000410036 382 ntTSL 519.94■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TCF25-214ENST00000565196 655 ntTSL 519.93■□□□□ 0.786e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFMBT1-203ENST00000474837 579 ntTSL 419.87■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-217ENST00000552109 1034 ntTSL 219.75■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-218ENST00000552928 545 ntTSL 319.75■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-215ENST00000592372 867 ntTSL 319.71■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AMN-203ENST00000558590 2772 ntTSL 219.55■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ATP2B1-209ENST00000551310 607 ntTSL 319.54■□□□□ 0.725e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)19.49■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.75e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-205ENST00000570322 1083 ntTSL 319.37■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CPLX2-205ENST00000509837 557 ntTSL 419.23■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFXN5-220ENST00000490056 906 ntTSL 1 (best)19.11■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EBF4-204ENST00000463145 642 ntTSL 519.05■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-215ENST00000529306 870 ntTSL 318.87■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-212ENST00000527485 873 ntTSL 218.87■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EGFR-208ENST00000459688 452 ntTSL 318.86■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-202ENST00000547219 611 ntTSL 518.72■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-207ENST00000550169 570 ntTSL 318.72■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 PRKCZ-224ENST00000503297 468 ntTSL 518.66■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-209ENST00000547351 807 ntTSL 218.47■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TNRC18-210ENST00000497663 588 ntTSL 218.4■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ASL-206ENST00000464970 640 ntTSL 318.21■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AC068580.4-202ENST00000636579 350 ntTSL 318.18■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ASL-208ENST00000488343 198 ntTSL 317.99■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-211ENST00000588767 807 ntTSL 517.93■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-217ENST00000593166 797 ntTSL 317.84■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EBF4-211ENST00000609967 2861 ntTSL 517.82■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 APOE-205ENST00000485628 771 ntTSL 1 (best)17.79■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AGPAT1-207ENST00000476663 746 ntTSL 517.64■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 MZT2A-205ENST00000488586 234 ntTSL 517.59■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFMBT1-205ENST00000483069 617 ntTSL 417.44■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-206ENST00000570500 473 ntTSL 217.4■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-209ENST00000573513 827 ntTSL 517.4■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 IDH3B-207ENST00000477689 608 ntTSL 517.39■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFMBT1-208ENST00000497586 699 ntTSL 417.15■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.255e-19■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TTLL3-212ENST00000430718 536 ntTSL 416.39■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TTLL3-203ENST00000414814 549 ntTSL 516.39■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CYB5R3-207ENST00000466276 581 ntTSL 416.19■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.175e-19■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SECTM1-207ENST00000582563 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.96■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SECTM1-208ENST00000583093 556 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.96■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AC096887.1-202ENST00000607283 690 ntAPPRIS P5 TSL 515.7■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ZNF331-208ENST00000504940 350 ntTSL 315.59■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TTLL3-205ENST00000418745 540 ntTSL 415.58■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 GTPBP2-205ENST00000442748 946 ntTSL 315.49■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-204ENST00000548154 597 ntTSL 215.49■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-203ENST00000547414 521 ntTSL 515.33■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-210ENST00000550937 781 ntTSL 515.33■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KNOP1-204ENST00000567367 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.07■□□□□ 05e-7■■■■■ 39.7
Retrieved 100 of 21,068 protein–RNA pairs in 391.5 ms